托克遜縣隸屬于新疆維吾爾自治區(qū)吐魯番市，位于新疆維吾爾自治區(qū)中東部，天山南麓，吐魯番盆地西部，地理坐標為：東經(jīng)87°14′05″-89°11′08″，北緯41°21′14″-43°18′11″，東與吐魯番市高昌區(qū)為鄰，南與巴州尉犁縣相接，西與巴州的和碩、和靜縣相連，北與烏魯木齊市毗鄰。縣城托克遜鎮(zhèn)距烏魯木齊市公路里程162千米。托克遜縣幅員面積16171.47平方公里，共有人口13.8萬人（2013年）。