木廠鎮原是東晉時期苞信縣（現境內鮑興村）的放牧場，明朝中后期，牧民多沿淠河兩岸放牧，后設廠為行政單位，明末清初改牧場為木廠，后因境內淠河水運發達而商賈云集，形成埠頭，故又稱作“木廠埠”。1945年木廠是六北縣人民政府機關駐地，解放后是鄉、公社、區所在地，1984年起設鎮。九九年被省批準為“綜合改革試點鎮”，同時被列入“全省200個中心鎮”，又列為“江淮分水嶺”鄉鎮。